特定の商品のみShopifyやスマレジのみの登録とし、連携しないことはできますか？

A. 可能です。連携機能を利用しつつ、連携を行いたくない商品がある場合は、「登録連携対象外」のタグを商品に付与することで登録されない商品を作成することが可能です。

また、商品の更新を対象外にしたい場合に関しましては「更新連携対象外」タグを商品に付与することで利用可能です。

上記はスマレジ、Shopify両方のプラットフォームにて付与することが可能です。