スマレジからの登録でカラーとサイズを入力しましたが、Shopifyにてバリエーション登録されません。

A. グループコードの入力、Smapifyの設定にてバリエーションの連携設定がONであることを確認してください。

バリエーション登録する際には上記項目は必須になるのでご確認ください。